Avidin是一种蛋白质,具有四个相同的亚基,每个亚基都能够结合四分子生物素。其分子量约为60kDa,是一种高度稳定的酸性糖蛋白。
Avidin的结构式是由四个相同的亚基组成,每个亚基含有128个氨基酸。它们在空间上排列成四个对称的亚基,这种四重对称性使得avidin具有高度稳定性。每个亚基都包含三个重要的结构域:生物素结合位点、疏水核心和折叠稳定域。
生物素结合位点是avidin最重要的结构域之一,它是由三个氨基酸残基组成的序列,包括赖氨酸、组氨酸和赖氨酸。这些氨基酸与生物素分子之间形成了非常紧密的氢键和疏水相互作用,从而使得生物素与avidin的结合非常紧密和稳定。
疏水核心是另一个重要的结构域,它由大量的疏水氨基酸组成,包括丙氨酸、异亮氨酸和亮氨酸等。这些氨基酸在avidin的结构中形成了一个疏水区域,起到了保持蛋白质稳定性的作用。
折叠稳定域是由大量的半胱氨酸和脯氨酸组成的序列,这些氨基酸通过二硫键交联在一起,形成了一个稳定的三维结构。这个结构域起到了保持整个亚基的稳定性的作用。
总之,avidin的结构式非常复杂,由四个相同的亚基组成,每个亚基都包含了生物素结合位点、疏水核心和折叠稳定域等重要结构域。这种四重对称性让avidin具有非常高的稳定性,使其成为生物素检测和生物分离的重要工具。